Die 3. Etappe führte das Feld über 184 Kilometer von La Vall d'en Bas nach Andorra-Vallnord. Zunächst wurde der Abschnitt von einer sechsköpfigen Ausreißergruppe bestimmt. Bis zu sieben Minuten betrug der Vorsprung, im Feld machte vor allem das Saxo-Bank-Team Tempo.
Der Schlussanstieg brachte erwartungsgemäß die Entscheidung. Die Ausreißer wurden einer nach dem anderen eingesammelt, während auch das Hauptfeld mehr und mehr zerfiel. Die entscheidende Attacke fuhr dann Contador etwa fünf Kilometer vor dem Ziel.
Der Tour-de-France-Sieger kam mit einem Vorsprung von 23 Sekunden auf den US-Amerikaner Levi Leipheimer (Radioshack) und dem Italiener Michele Scarponi (Lampre-ISD) an der Skistation an. Neben dem Tagessieg übernahm "El Pistolero" auch die Führung im Gesamtklassement. Der bisherige Spitzenreiter Gatis Smukulis (HTC-Highroad) fiel früh zurück.
Mitfavorit Ivan Basso (Liquigas) kam als Siebter mit 38 Sekunden Rückstand ins Ziel und Cadel Evans (BMC-Racing) verlor 50 Sekunden. Deutsche Fahrer konnten sich nicht auf den vorderen Rängen platzieren. Als 59. hatte Linus Gerdemann (Leopard-Trek) bereits einen Rückstand von 7:44 Minuten.
"Ich habe so einen Vorsprung nicht erwartet", sagte Contador. Seine Mannschaft habe vom ersten Kilometer an einen unglaublichen Job gemacht. "Wir haben gleich die Verantwortung übernommen", sagte der 28-Jährige überrascht von sich selbst.
Die 4. Etappe führt das Feld über insgesamt 195 Kilometer von La Seu D'Urgell nach El Vendrell.
3. Etappe, La Vall d'en Bas – Vallnord/Andorra (183,9 km):
1. Alberto Contador (Spanien) – Saxo Bank SunGard 4:45:31 Std.; 2. Michele Scarponi (Italien) – Lampre-ISD + 0:23 Min.; 3. Levi Leipheimer (USA) – Radioshack gleiche Zeit; 4. Daniel Martin (Iran) - Garmin-Cervélo + 0:35; 5. Chris Horner (USA) – Radioshack; 6. Alex Cano (Kolumbien) – Colombia es Pasión beide gleiche Zeit; ...59. Linus Gerdemann (Münster) – Leopard-Trek + 7:44; 126. Patrick Gretsch (Erfurt) – HTC-Highroad + 14:22; 157. Paul Martens (Maastricht/Niederlande) – Rabobank + 21:04
Gesamtwertung, nach der 3. Etappe:
1. Alberto Contador (Spanien) – Saxo Bank SunGard 13:05:55 Std.; 2. Levi Leipheimer (USA) – Radioshack + 0:23 Min.; 3. Michele Scarponi (Italien) – Lampre-ISD gleiche Zeit; 4. Daniel Martin (Irland) – Garmin-Cervélo + 0:35; 5. Chris Horner (USA) – Radioshack; 6. Rigoberto Uran (Kolumbien) – Sky beide gleiche Zeit; ...57. Linus Gerdemann (Münster) – Leopard-Trek + 7:44; 127. Patrick Gretsch (Erfurt) – HTC-Highroad + 22:47; 159. Paul Martens (Maastricht/Niederlande) – Rabobank + 32:18